肺脓肿的治疗疗程一般是6到8周，停药的指征为咳嗽，咳痰，气喘，高热症状完全消失，肺ct或胸片提示空洞消失，只留有少许的纤维条索状影，肺脓肿一旦确诊后，需要进行积极的治疗，首先我们要使用抗生素进行治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，例如青霉素，甲硝唑，奥硝唑，克林霉素等等。

同时，我们要完善痰培养的检查，可根据药敏的结果，更换抗生素，注意痰液的引流，包括体内引流和使用祛痰药物，祛痰药物包括氨溴索，桉柠蒎，乙酰半胱氨酸等，经过上述治疗无效的情况下，可以考虑介入的治疗方法，支气管镜可局部给药，并促进痰液的引流，如果介入治疗无效的情况下，我们可根据肺脓肿的类型采取手术的治疗方法。

肺脓肿治疗周期相对比较长，目前临床大约需治疗6-8周。因为肺脓肿是化脓性坏死性炎症，肺组织可以产生脓腔，脓腔也是一种肺部感染性疾病。此时感染的病原菌可以是厌氧菌，如金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌或者肺炎克雷伯杆菌。可以通过呼吸道吸入感染，也可以是血液感染。细菌对肺组织造成慢性化脓性空腔或者空洞，称为肺脓肿。

一般厌氧菌即金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌、肺炎克雷伯杆菌引起化脓性感染，常规要使用抗生素，进行抗感染治疗。要采取积极引流，若脓腔很大的情况可以考虑胸外科脓液引流，或者到胸外科做胸壁引流，做气管镜也可以把痰液、脓液吸出。总体治疗疗程比较长，用抗生素的时间也比较长，原则上需要1-2个月。口服抗生素到复查胸片或者肺部CT，空洞消失或者炎症消失，仅留下纤维化残留后，可以考虑停用抗生素。