肺脓肿的治疗疗程一般是6到8周，停药的指征为咳嗽，咳痰，气喘，高热症状完全消失，肺ct或胸片提示空洞消失，只留有少许的纤维条索状影，肺脓肿一旦确诊后，需要进行积极的治疗，首先我们要使用抗生素进行治疗，抗生素要覆盖厌氧菌，例如青霉素，甲硝唑，奥硝唑，克林霉素等等。

同时，我们要完善痰培养的检查，可根据药敏的结果，更换抗生素，注意痰液的引流，包括体内引流和使用祛痰药物，祛痰药物包括氨溴索，桉柠蒎，乙酰半胱氨酸等，经过上述治疗无效的情况下，可以考虑介入的治疗方法，支气管镜可局部给药，并促进痰液的引流，如果介入治疗无效的情况下，我们可根据肺脓肿的类型采取手术的治疗方法。

肺脓肿是指肺内发生感染后形成的局限性脓肿，从病因学和症状学两个角度，治疗首先需要抗感染，抗感染需明确可能感染的病原菌，可以气管镜检取痰标本，进行细菌培养和分型，应用合理抗菌药物，可以单药应用，也可以联合其它药物。如怀疑存在真菌感染形成脓肿，需要使用抗真菌药。还要对症处理进行引流，对于大的肺脓肿可以进行胸壁穿刺引流，将脓肿排出形成空洞，通过药物治疗、感染吸收、空洞闭合，是肺脓肿较好的治疗方法。

还可以应用外科手术方法，进行肺脓肿切除；慢性肺脓肿药物治疗效果较差、无法吸收，可以通过胸外科微创手术进行肺脓肿及所在周围肺组织切除，达到治疗肺脓肿的目的。