肺脓肿穿刺引流的副作用如下：

1.出血。肺脓肿穿刺引流是一种有创手术，手术过程可能会损伤血管，导致胸腔出血或咯血。

2.气胸和纵隔气肿。肺脓肿穿刺穿破肺泡，肺脓肿脓肿腔与支气管相连，肺内气体进入胸腔引起气肿。手术损伤支气管鞘膜，气体进入支气管鞘膜，可引起纵隔气肿。

3.胸腔感染。肺脓肿穿刺引流后，部分脓液沿引流管外侧进入胸腔，引起胸腔感染。

4.支气管胸膜瘘。穿刺引流后脏层胸膜穿刺口不愈合形成支气管胸膜瘘。

肺脓肿穿刺引流不会有太多的后遗症。当肺脓肿形成时，在CT或B超的指导下，穿刺引流可以尽快排出脓腔内的脓液，从而增加抗感染治疗的效果。同时，促进痰液排出和痰液治疗，有助于吸收肺脓肿。当脓肿在后期完全吸收时，往往会形成局限性的显微钙化炉，形成显微信斑点。急性肺脓肿和抗生素治疗后，如果穿刺引流脓液排出，充分效果仍然不佳，可以进行手术治疗。如果慢性肺脓肿经内科治疗三个月以上仍重复，可直线切除肺叶。

肺脓肿穿刺引流一般不是特别安全。因为胸部穿刺是一种创造性的手术，有一定的风险。肺脓肿穿刺的目的是穿刺和抽脓，然后进行细菌学检查和药敏试验。细菌学检查可以清楚什么样的细菌会引起肺脓肿，如金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌等。因此，有必要进行穿刺，然后进行细菌培养。