治疗方法的选择应依据肿瘤的大小和数目、肿瘤侵袭的部位和范围、静脉癌栓和远处转移情况、患者肝脏功能代偿程度以及全身状况（年龄、心肺功能、糖尿病、其他脏器病变等)通过全面衡量决定。概括地说，主要基于以下3点:肿瘤情况，肝脏功能情况，全身情况。

1.肿瘤情况
首先是位置，能不能切?外周易切，中央难施;值不值得切?肿瘤偏于肝脏中央，在切除癌肿时，也切除大量正常肝组织，应考虑手术后肝脏功能是否可以代偿，值不值得切的问题;易切难切?主要是和血管的关系问题。其次是大小，一般应保证远离肝癌⒉厘米切除。最后是分化，病理上将它分为4级，I级高分化，接近正常细胞，恶性程度不高;Ⅱ～Ⅲ级中度分化，中度恶性;Ⅳ级分化最差，恶性程度最高。分化差的肿瘤通常没有包膜、肿瘤生长较快、多呈浸润性生长、多见转移病灶，往往无法手术。
2.肝脏功能状况
如果肝脏功能失代偿，其指标:①胆红素≥>20pmol/L;②白蛋白/球蛋白比倒置;③凝血酶原时间低于正常值的50%。这往往无法手术，即使是肝动脉栓塞化疗或局部放疗也很难进行，可能导致肝脏功能严重损伤，甚至出现肝脏功能衰竭。
3.全身情况
包括年龄、心肺功能、有无糖尿病、其他脏器病变等，也可能影响治疗方案的选择。例如小肝癌患者有肝炎病史，但肝脏功能代偿者，手术切除为首要选择;对有肝硬化者，可做局部切除。不适于做手术切除者，可选择局部治疗，如冷冻治疗、微波固化或无水酒精瘤内注射。小肝癌合并肝硬化者，如肝脏功能轻度异常，可考虑做无水酒精瘤内注射或超选择肝动脉栓塞化疗。但对肝脏功能严重失代偿者，只宜保守治疗。
中医药（疏通血瘀法）保守治疗肝癌，现在已经被患者所认可，一般中药治疗肝癌，具有扶正抗癌的效果，对于晚期的肝癌患者或者是肝功能严重损伤，没有其他方法治疗的患者，效果更占一些优势，治疗肝癌主要有三个特点：第一是整体治疗辨证施治、第二提高患者的免疫力；第三可以有效的保护肝脏的正常细胞；在扶正祛邪的过程当中，使肝癌患者生存质量能够得到保存，延长患者的生存期。